L'aula IV fu la sala della prima biblioteca dell’Istituto delle Scienze di Bologna, fondato da Luigi Ferdinando Marsili negli anni 1711-1714. Venne approntata nel biennio 1724-1725 su progetto dell’architetto Giovan Battista Piacentini e ad opera di Francesco Maria Zanotti, bibliotecario dal 1721 al 1723, quindi segretario dell'Istituto.
Arredata con scansie povere, ebbe l'attuale sistemazione dopo le soppressioni conventuali napoleoniche, quando oltre a un ingente numero di libri, codici e manoscritti, giunsero in biblioteca varie suppellettili e scansie. In particolare, parte della scaffalatura dell'aula IV provenne dalla libreria del convento di San Michele in Bosco e fu integrata dopo il 1813 con materiale proveniente dalla libreria del convento di San Francesco.
Attualmente ospita la mostra permanente di manoscritti e libri antichi a stampa della collezione di Marsili, che costituisce il nucleo originario e fondativo della Biblioteca Universitaria, dell'eredità di Ulisse Aldrovandi (1522-1605) e della donazione di Papa Benedetto XIV (1675 - 1758).
